scikit-image 0.13.1 (2017-09-27)#
scikit-image 0.13.1 是一個錯誤修復和相容性更新版本。有關 0.13.0 中許多新功能,請參閱下文。
0.13.1 的主要貢獻是 Jarrod Millman 的努力工作,確保 scikit-image 可以同時與 NetworkX 1.11 和 2.0 (#2766) 搭配使用。其他更新包括
由 GitHub 使用者 @zhongzyd (#2690) 修正的相似轉換估計中的錯誤
Gregory Lee (#2650, #2640) 修正
skimage.util.plot_matches
和denoise_wavelet
中的錯誤Egor Panfilov (#2716) 和 Jirka Borovec (#2524) 的文件更新
Gregory Lee (#2666, #2731)、Nelle Varoquaux (#2722) 和 Stéfan van der Walt (#2723, #2810) 修正的文件建置問題
scikit-image 0.13.0 (2017-03-29)#
我們很高興(終於)宣佈發布 scikit-image v0.13.0!
scikit-image 是一個用於 SciPy 的影像處理工具箱,包含用於分割、幾何轉換、色彩空間操作、分析、濾波、形態學、特徵偵測等演算法。
如需更多資訊、範例和文件,請造訪我們的網站
https://scikit-image.dev.org.tw
以及我們的範例圖庫
https://scikit-image.dev.org.tw/docs/dev/auto_examples/
重點#
此版本是經過一年的努力,由 82 位貢獻者提交超過 200 個提取請求的成果。重點包括
改進的 n 維影像支援。此版本增加了 nD 對以下項目的支援
用於質心的
regionprops
計算 (#2083)segmentation.clear_border
(#2087)Hessian 矩陣 (#2194)
此外,以下新函數支援 nD 影像
新的小波去噪函數
restoration.denoise_wavelet
(#1833, #2190, #2238, #2240, #2241, #2242, #2462)新的閾值函數
filters.threshold_sauvola
和filters.threshold_niblack
(#2266, #2441)新的局部最大值、局部最小值、hmaxima、hminima 函數 (#2449)
灰階共生矩陣 (GLCM) 現在可與 uint16 影像搭配使用
filters.try_all_threshold
可快速查看各種閾值方法的輸出Frangi 和 Hessian 濾波器(僅限 2D)(#2153)
segmentation.watershed
中的新*緊湊分水嶺*演算法 (#2211)feature.shape_index
中的新*形狀索引*演算法 (#2312)
新函數和功能#
新增最小閾值演算法 (#2104)
實作平均值和三角形閾值處理 (#2126)
新增 Frangi 和 Hessian 濾波器 (#2153)
將 bbox_area 新增至區域屬性 (#2187)
colorconv:新增 rgba2rgb() (#2181)
Lewiner 行進立方體演算法 (#2052)
影像反轉 (#2199)
小波去噪(來自 #1833)(#2190)
從影像估計雜訊標準差的常式 (#1837)
新增緊湊分水嶺並清除現有的分水嶺 (#2211)
新增遺失的「grey2rgb」函數。 (#2316)
形狀索引 (#2312)
基本和必要矩陣 8 點演算法 (#1357)
新增 YUV、YIQ、YPbPr、YCbCr 色彩空間
從形態學偵測局部極值 (#2449)
夏儂熵 (#2416)
文件改進#
在貢獻頁面中新增有關 GitHub SSH 金鑰的詳細資訊 (#2073)
新增 Felzenszwalb 影像分割的範例 (#2096)
用於範例圖庫的 Sphinx 圖庫 (#2078)
改進的區域邊界 RAG 文件 (#2106)
新增圖庫 Lucy-Richardson 反褶積演算法 (#2376)
圖庫:使用馬來說明凸包 (#2431)
在使用者指南中新增使用 OpenCV 的說明 (#2519)
程式碼改進#
從測試套件中移除 lena 影像 (#1985)
移除 skimage.feature.match_template 中的重複平均值計算 (#1980)
將 nD 支援新增至 clear_border (#2087)
新增共生矩陣的 uint16 影像支援 (#2095)
新增高斯和中值濾波器的預設參數 (#2151)
try_all 以選擇最佳閾值演算法 (#2110)
在 Felzenszwalb 分割中新增多通道支援 (#2134)
改進的 SimilarityTransform,新的 EuclideanTransform 類別 (#2044)
ENH:加快 Hessian 矩陣計算速度 (#2194)
將 n 維支援新增至 denoise_wavelet (#2242)
加快
inpaint_biharmonic
速度 (#2234)更新 Hessian 矩陣程式碼以包含 order kwarg (#2327)
處理 label2rgb 的情況,其中輸入標籤為負值和/或不連續 (#2370)
新增 watershed_line 參數 (#2393)
API 變更#
移除已淘汰的
filter
模組。改用filters
。 (#2023)移除
skimage.filters.canny
連結。改用feature.canny
。 (#2024)移除 Python 2.6 支援和相關檢查 (#2033)
移除已淘汰的 {h/v}sobel、{h/v}prewitt、{h/v}scharr、roberts_{positive/negative} 濾波器 (#2159)
移除已淘汰的
_mode_deprecations
(#2156)移除
rescale_intensity
中已淘汰的 None 預設值 (#2161)參數
ntiles_x
和ntiles_y
已從exposure.equalize_adapthist
中移除現在 NumPy 的最低版本為 1.11,SciPy 的最低版本為 0.17
淘汰#
clip_negative 在版本 0.15 中預設值將設為 false (func: dtype_limits) (#2228)
淘汰「dynamic_range」,改用「data_range」(#2384)
在 0.15 版中,
radon
和iradon
轉換的circle
引數的預設值將為True
(#2235)在 0.15 版中,
denoise_bilateral
和denoise_nl_means
的multichannel
預設值將為False
在 0.15 版中,
feature.hog
中的block_norm
預設值將為 L2-Hysteresis。已淘汰
threshold_adaptive
函數。改用threshold_local
。在 0.15 版中,
transform.swirl
、resize
和rescale
中的mode
預設值將為「reflect」。
此版本的貢獻者#
AbdealiJK
Rodrigo Benenson
Vighnesh Birodkar
Jirka Borovec
François Boulogne
Matthew Brett
Sarwat Fatima
Rachel Finck
Joe Futrelle
Jeroen Van Goey
Christoph Gohlke
Roman Golovanov
Emmanuelle Gouillart
Anshita Gupta
David Haberthür
Jeff Hemmelgarn
Hiyorimi
Daniel Hyams
Alex Izvorski
Kyle Jackson
Jirka
JohnnyTeutonic
Kevin Keraudren
Almar Klein
Yu Kobayashi
Moriyoshi Koizumi
Lachlan
LachlanD
George Laurent
Gregory R. Lee
Evan Limanto
Ben Longo
Victor MARTIN
Oliver Mader
Ken’ichi Matsui
Jeremy Metz
Jeyson Molina
Michael Mueller
Juan Nunez-Iglesias
Egor Panfilov
Paul
PengchengAi
Francisco de la Peña
Pavlin Poličar
Orion Poplawski
Zoe Richards
Todd V. Rovito
Christian Sachs
Sanya
Johannes Schönberger
Pavel Shevchuk
Scott Sievert
Steven Silvester
Shaun Singh
Sourav Singh
Alexandre Fioravante de Siqueira
Samuel St-Jean
Noah Stier
Ole Streicher
Martin Thoma
Matěj Týč
Viraj
Stefan van der Walt
Josh Warner
Olivia Wilson
Robin Wilson
Martin Zackrisson
Yue Zheng
Nick Zoghb
alexandrejaguar
almar
cespenel
danielballan
dmesejo
eli
jwittenbach
lgeorge
mljli
rjeli
skrish13
tseclaudia
walter
此版本中合併的提取請求#
若使用者嘗試使用較舊的 Cython 版本建置時發出警告 (#1986)
從測試套件中移除 lena 影像 (#1985)
將 inpaint 加入模組初始化 (#1987)
預先計算範本平均值 (#1980)
rgb2grey -> grey2rgb (#1989)
也將 rgb2gray 作為 rgb2grey 公開 (#1990)
在清除時移除所有 .md5 檔案 (#1992)
當使用 multichannel=True 呼叫 compute_ssim 時,避免出現棄用警告 (#1994)
DOC:在 compute_ssim 錯誤中建議使用 multichannel=True (#1999)
[DOC] 新增指南連結 (#2001)
修正 CONTRIBUTING 中的 docs–>doc (#2009)
將
dask
變成可選的相依性 (#2013)修正捕捉 mpl 警告的正規表示式 (#2014)
BUILD:在 Travis pip 安裝中使用 –pre 標記 (#1938)
Github 範本 (#1954)
為 PaintTool 新增文件 (#1934)
skimage.segmentation.quickshift 簽名從 API 文件中遺失 (#2017)
MAINT:升級 tifffile (#2016)
修改 .gitignore 以正確忽略 auto_example 檔案 (#1966)
MAINT:在 CI 建置中從 coveralls 切換到 codecov (#2015)
skimage.segmentation.quickshift 簽名從 API 文件中遺失,第三次嘗試 (#2021)
MAINT:移除已棄用的
filter
模組 (#2023)移除
skimage.filters.canny
連結 (#2024)記錄 regionprops bbox 屬性。 (#2030)
修正 texturematch 論文的 URL (#2031)
改進 skimage.segmentation.active_contour 輸入參數的 dtype 支援 (#2032)
修正本地測試函式 (#2034)
移除 Python 2.6 支援和相關檢查 (#2033)
在 OSX 上測試 (#2038)
將覆蓋率徽章變更為 codecov (#2055)
TST:加速雙邊濾波器測試 (#2061)
加速 colorconv._convert (#2064)
FIX:修正 qt_plugin 中 'warn' 的導入 (#2070)
新增 YUV、YIQ、YPbPr、YCbCr 色彩空間
在 contributing 頁面中新增有關 github SSH 金鑰的詳細資訊 (#2073)
ENH:將 np.random.RandomState 傳遞給 RANSAC (#2072)
使用 tifffile 處理 IO 物件 (#2046)
更新質心以使用座標 - 在 3D 中運作 (#2083)
[WIP] 區域邊界 RAG 的階層式合併 (#2058)
將 nD 支援新增至 clear_border (#2087)
DOC:更新為新的 API(次要)(#2090)
新增 Felzenszwalb 影像分割的範例 (#2096)
DOC:在變數定義的欄位前新增空格(次要...)(#2102)
DOC:引導新貢獻者使用 HTTPS,而非 SSH (#2082)
將 François Boulogne 加入 mailmap (#2117)
將 skimage.filters.rank 描述和 todos 從 README 移至文件字串。 (#2115)
修正 Otsu 閾值的錯誤和文件 (#2118)
將 scuinto 的第二個電子郵件地址加入 mailmap (#2122)
MAINT:關於標籤和 regionprops 函式。 (#2100)
新增最小閾值演算法 (#2104)
用於範例圖庫的 Sphinx 圖庫 (#2078)
DOC:縮短圖庫中的標題 (#2128)
DOC:使用清單重構軸 (#2129)
DOC ENH + houghline 轉換的 API 修正 (#2089)
修正範例指令碼的縮排 (#2136)
實作平均值和三角形閾值處理 (#2126)
將
skimage.measure.label
參考移至文件字串 (#2143)修正過時的 GraphicsGems 連結 (#2149)
文件字串 (#2145)
新增共生矩陣的 uint16 影像支援 (#2095)
移除已棄用的 {h/v}sobel, {h/v}prewitt, {h/v}scharr, roberts_{positive/negative} 濾波器 (#2159)
移除已淘汰的
_mode_deprecations
(#2156)預設參數 (#2151)
ENH:try_all 選擇最佳閾值演算法和 DOC 重構 (#2110)
BUGFIX:inverse_map 不應為 None (#2160)
將 felzenszwalb 灰階切換為多通道版本 (#2134)
greycomatrix 的寫作、樣式和 PEP8 修正 (#2157)
新增 Frangi 和 Hessian 濾波器 (#2153)
改進的 SimilarityTransform,新的 EuclideanTransform 類別 (#2044)
color.colorconv:修正 rgb2gray() 的文件 (#2169)
修正
segmentation.felzenszwalb
中的區域合併 (#2164)移除
rescale_intensity
中已淘汰的 None 預設值 (#2161)DOC:在 template_match 中新增註解 (#2176)
為 numpy_images.rst 新增章節標題格式 (#2177)
修正 threshold_triangle 以適用於非整數影像。 (#2171)
改進的區域邊界 RAG 文件 (#2106)
ENH 將 bbox_area 加入區域屬性 (#2187)
colorconv:新增 rgba2rgb() (#2181)
DOC:將 DOI 加入參考文獻 (#2188)
移除 try_all_threshold 中的本地閾值 (#2180)
DOC:新增關於警告處理的註解 (#2198)
ENH:加快 Hessian 矩陣計算速度 (#2194)
為資料新增遺失的單元測試,並將馬轉換為二進位 (#2196)
修正 ssim 範例 (#2208)
[MRG] MAINT:以 filters.gaussian 取代 gaussian_filter (#2210)
[MRG] DOC:更正 mssim 文件字串以傳回 float (#2218)
FEAT:Lewiner 行進立方體演算法 (#2052)
修正鹽和胡椒雜訊中的錯誤 (#2223)
TST:更新 AppVeyor 以使用 Conda,新增 msvc_runtime (#2217)
改進標題的文件字串 (#2185)
新增維基百科上的任務更新版本 (#2230)
NEW + DOC:影像反轉 (#2199)
ENH:實作小波去噪(來自 #1833)(#2190)
TEST:在 setup() 中定義 seed / 修正隨機測試失敗 (#2227)
將 n 維支援新增至 denoise_wavelet (#2242)
API:clip_negative 將在 0.15 版本中預設設定為 false(函式:dtype_limits)(#2228)
加快
inpaint_biharmonic
速度 (#2234)MAINT dtype.py (PEP8) (#2231)
移除未使用的 extend_image (#2251)
ENH:從影像估計雜訊標準差的常式 (#1837)
將 sphinx 建置限制為單一程序。移除供應商 numpydoc。 (#2257)
在 threshold_otsu 警告中新增更具體的影像形狀檢查 (#2259)
允許在未安裝 numpy 的情況下執行
setup.py egg_info
。 (#2260)新增緊湊分水嶺並清除現有的分水嶺 (#2211)
直接使用 numpy.pad,移除 util.pad 中的大部分已出貨程式碼 (#2265)
DOC:修正參考文獻 (#2262)
DOC:圖庫中的微小修正 (#2226)
DOC:修正錯字 (#2274)
更新 Manifest.in (#2255)
修正無界限相關性 – Dhyams 修正範本比對 (#2263)
DOC:重構圖庫中的骨架化範例 (#2141)
[MRG+1] 在 skimage.data.* 中的影像文件字串中插入中繼資料 (#2236)
MAINT:Radon(文件字串、API、PEP8)(#2235)
[MRG+2] MAINT:修正 numpy 棄用 (#2283)
減少繪圖周圍的空白 (#2144)
[MRG+1] 預設情況下,clear_border 不是就地執行 (#2285)
移除
transform.{pyx/pxd}
中未使用的導入 (#2288)[MRG+1] 在文件導覽中新增社群指南 (#2287)
將色彩新增至 IHC (#2279)
FIX:如果指定了標籤,則選擇 num_peaks (#2098)
[MRG+1] 新增 felzenszwalb 形狀驗證 (#2286)
[MRG+1] 在 _wavelet_threshold 中更緊密地比對 BayesShrink 論文 (#2241)
移除
subplots_adjust
的使用 (#2289)[MRG+1] 變更文件頁面圖示 (#2291)
[MRG+1] TST:偏好使用 numpy.testing 中的
assert_
而非 assert (#2298)TSTFIX:針對 scipy 的開發版本修正錯誤 (#2302)
增強
compare_ssim
文件字串 (#2314)新增遺失的「grey2rgb」函數。 (#2316)
PEP8 (#2304)
為公開的 Cython 函式建立 Python 包裝函式 (#2303)
更新郵寄清單位置 (#2328)
形狀索引 (#2312)
在 DEPENDS.txt 中將 pywavelets 新增至執行階段需求 (#2238)
重構
skimage.draw
中的變數名稱 (#2321)修正列印錯誤訊息時的顯示問題 (#2326)
在 threshold_li 中新增對零影像的捕獲 (#2338)
FIX:修改 peak_local_max 以使用 relabel_sequential (#2341)
更新 _static 中的圖示 (#2355)
移除 rgb2hsv 和 h… 的文件字串中不正確的輸入類型假設 (#2354)
更新 transform.swirl 中的預設邊界模式 (#2331)
更新 imread() 文件 (#2358)
檢查 random_walker() 中的有效模式。 (#2362)
修正 nose/travis 未執行的 _shared 中 1 個損壞的測試 (#2229)
更新 Hessian 矩陣程式碼以包含 order kwarg (#2327)
釐清 sk… 文件中 beta1 和 beta2 參數的用途 (#2382)
處理 label2rgb 的情況,其中輸入標籤為負值和/或不連續 (#2370)
更新
exposure.equalize_adapthist
引數和文件字串 (#2220)修正使用者指南中 (x, y) 原點描述 (#2385)
更新 show_rag 方法的文件字串 (#2375)
修正列印錯誤訊息時的顯示問題 (#2372)
在 _shared.utils.py 中新增對空陣列的檢查 (#2364)
修正無峰值 blob log (#2349)
ENH:使用 orientation kwarg 擴充 draw.ellipse (#2366)
基本和必要矩陣 8 點演算法 (#1357)
修正 Travis 註解的參考 (#2403)
修正 sphinx 中已棄用的選項,該選項會在 travis 中導致警告視為錯誤 (#2395)
更新 Travis 指令碼 (#2374)
移除 freeimage 外掛程式 (#1933)
修正直方圖的形狀類型 (#2417)
將照明體和觀察者參數新增至 rgb2lab 和 lab2rgb 函式。 (#2306)
PEP8 (#2413)
MAINT:合併 dtype 清單 (#2420)
(部分)符合
pep8
標準 (#2392)新增標題和文字,使 plot_brief.py 範例更清晰 (#2193)
DOC:新增標準照明體參考 (#2418)
在子圖中新增標題和文字,使 plot_censure.py 範例更容易讓新手理解 (#2191)
淘汰「dynamic_range」,改用「data_range」(#2384)
使 PR 2266 與 n-D 相容 (#4)
根據 Guo 和 Hall 1989 新增新的「細線化」方法 (#2294)
本地閾值 niblack sauvola(來自 Jeysonmc PR)(#2266)
穩定的橢圓擬合 (#2394)
新增圖庫 Lucy-Richardson 反褶積演算法 (#2376)
根據註解和 StackOverflow 改進 SIFT 載入器文件字串 (#2404)
變更為 Javascript 載入搜尋索引(Julian Taylor 的修補程式)(#2438)
修正連通元件中的分段錯誤(Yaroslav Halchenko 的修補程式)(#2437)
重構
util/dtype.py
(#2425)ENH:圖庫,各種小樣式修正 (DFT 範例)。 (#2430)
使 peak_local_max 傳回已排序的索引,一律如此 (#2435)
更正 probabilistic_hough_line() 的註解。 (#2448)
新增 watershed_line 參數 (#2393)
解決 Gaussian 值範圍 #2383 (#2388)
圖庫:使用馬來說明凸包 (#2431)
MRG:更新 Python 3.6 的建置矩陣 (#2451)
YCbCr 色彩空間中的小波去噪 (#2240)
圖庫:為硬幣使用灰階色彩對應 (#2459)
修正 Sauvola 和 Niblack 閾值的錯誤 (#2441)
MAINT:移除 _wavelet_threshold 文件字串 (#2460)
BUG:修正奇數長度輸入的 denoise_wavelet (#2462)
MAINT:針對 denoise_{bilateral, nl_means} 中的新多通道預設值發出警告 (#2467)
圖庫中針對去噪的各種增強功能 (#2461)
用於檢查 sdist 完整性的工具 (#2085)
新增不同的
skimage.hog
區塊正規化方法 (#2040)DOC:修正錯字並新增參考文獻 (#2478)
將 sphinx 圖庫更新至 0.1.8 (#2474)
DOC:修正 Gaussian 濾波器文件字串中的錯字 (#2487)
新增 threshold_local,棄用舊的 threshold_adaptive API (#2490)
調整大小和縮放的預設邊緣模式變更 (#2484)
將
dask[array]
新增至可選需求 (#2494)DOC:在 CONTRIBUTING.txt 中新增指示,並更新 Windows 的 git 安裝連結 (#2495)
ENH:一般化 hough_peak 函式 (#2109)
修正圖庫範例 (#2504)
提高最低 scipy 版本 (#2254)
DOC:img_as_float 如果輸入 dtype 為 float,則新增關於範圍的註解 (#2499)
更新 tifffile 以進行 2017.01.12 變更 (#2497)
在文件字串中以 block_reduce 取代 local_sum。 (#2498)
MAINT:將 scipy 的 truncate 參數傳遞至 Gaussian 濾波器 API (#2508)
DOC:圖庫:加入分割:增強 (#2507)
整理開發文件部署 (#2516)
對於正常建置,不要求 cython (#2509)
修正 Python 3.6 的損壞
test_ncut_stable_subgraph
,在 Travis 中啟用 Python 3.6 (#2511)改進背景標記 (#2381)
對於 imread 的 load_func,使 img_num 引數成為可選 (#2054)
使其與目前的 networkx master 相容 (#2455)
HOG 程式碼中的雜項整理 (#2526)
BUG:修正當 ORB 未傳回任何描述子時的 NumPy 錯誤 (#2537)
BUG:零影像的 restoration.denoise_bilateral 中的 ValueError (#2533)
修正 Python XY 的連結 (#2542)
TST:修正 scipy-0.19.0rc2 的 ValueError (#2544)
DOC:更新 data.coins() 的 URL (#2548)
以 Flickr URL 取代 GRIN URL (#2547)
使
threshold_minimum
在 i686 和 x86_64 上傳回相同的結果 (#2549)次要修正 (Issue #2554) (#2556)
從
filters.threshold_sauvola
文件字串中移除offset
參數 (#2566)閱讀影片檔案的實用指南 (#1012)
從
requirements.txt
中移除 dask (#2572)修正
morphology.watershed
錯誤訊息 (#2570)DOC:在使用者指南中新增使用 OpenCV 的說明 (#2519)
NEW:新增 shannon entropy (#2416)
修正 GLCM 示範的 ylabel 中的錯字 (#2576)
從形態學偵測局部極值 (#2449)
將極值函數加入
__init__
(#2588)